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植物表型組學的展望-WIWAM植物表型成像系統(tǒng)

更新時間:2019-06-04 點擊量:1987

表型組學是突破未來作物學研究和應(yīng)用的關(guān)鍵研究領(lǐng)域,通過表型分析來描述關(guān)鍵性狀可以為育種、栽培和農(nóng)業(yè)實踐提供基于大數(shù)據(jù)的決策支持。但是,沒有針對性的全表型標記在植物研究領(lǐng)域中是沒有太多實際意義的。即使只針對某一個物種,全表型測量會產(chǎn)生海量、無重點的數(shù)據(jù)集。在今后相當長的時間內(nèi)數(shù)據(jù)解析方法很難從這類數(shù)據(jù)集中地總結(jié)共性規(guī)律。并提取有生物學意義的信息。對于希望在植物研究中使用表型組學的團隊而言,這樣的科研方式也是比較低效的。因此,表型組研究需要明確的目標是在快速篩選關(guān)鍵性狀集的基礎(chǔ)上,為針對性解決科學問題提供決策數(shù)據(jù),體現(xiàn)研究的實際應(yīng)用價值,需重點指出的是表型組學研究不等同于表型儀器的購置,各類表型設(shè)備只是完成了數(shù)據(jù)采集工作而真正對生物學有意義的表型組信息需要由跨學科團隊的緊密合作來完成,無論是利用F1/F2等分離群體開展植物數(shù)量性狀位點分析。還是利用近等基因系等開展基因克隆研究,選擇表型設(shè)備和分析手段應(yīng)明確目的,即為更好解決具體的生物學問題服務(wù)。

表型組學的巨大潛力還體現(xiàn)在其與其他組學研究。如基因組學、表觀組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白組學、代謝組學和離子組學等)知識的綜合分析。量化分析特定表型的遺傳規(guī)律。對作物細胞、器官、群體不同層次的監(jiān)控,作物在不同發(fā)育階段的動態(tài)性狀的獲取,并與其他組學分析結(jié)果融合,可對重要生命過程進行多方位的解釋,中國幅員遼闊各地區(qū)實際情況差別較大,有必要針對不同生態(tài)環(huán)境中的作物表型組和其他組學數(shù)據(jù)進行整合和交叉驗證,揭示農(nóng)業(yè)植物生物學規(guī)律切實支撐中國各類作物的生理學、發(fā)育學、遺傳學、育種、栽培以及農(nóng)業(yè)大田生產(chǎn)等研究提升中國作物遺傳育種、栽培管理和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)服務(wù)能力。

WIWAM植物表型成像系統(tǒng)由比利時SMO公司與GHent大學VIB研究所研制生產(chǎn),整合了LED植物只能培養(yǎng)、自動化控制系統(tǒng)、葉綠素熒光成像測量分析、植物熱成像分析、植物近紅外成像分析、植物高光譜分析、植物多光譜分析、植物CT斷層掃描分析、自動條碼識別管理、RGB真3D成像等多項*技術(shù),以優(yōu)化的方式實現(xiàn)大量植物樣品以優(yōu)化的方式實現(xiàn)大量植物樣品——從擬南芥、水稻、玉米到各種其它植物的生理生態(tài)與形態(tài)結(jié)構(gòu)成像分析,用于高通量植物表型成像分析測量、植物脅迫響應(yīng)成像分析測量、植物生長分析測量、生態(tài)毒理學研究、性狀識別及植物生理生態(tài)分析研究等。

SMO是歐洲的機械設(shè)備制造與設(shè)計工程公司,是一家將大規(guī)模自動化理念和工業(yè)零件和設(shè)備整合入植物成像系統(tǒng)的廠家,在機械自動化以及機械視覺成像領(lǐng)域擁有豐富的設(shè)計和實踐經(jīng)驗,為歐洲客戶提供機械設(shè)計解決方案,SMO公司將機械領(lǐng)域的*理念帶入了植物表型機器人領(lǐng)域,所采用的配件均為工業(yè)界廣泛認可的高品質(zhì)配件,耐受苛刻環(huán)境,另外表型設(shè)備領(lǐng)域的諸多自動化配件,均由SMO公司自主設(shè)計,因公司擁有極為強大的工程師團隊,基于工業(yè)領(lǐng)域的豐富經(jīng)驗,可針對不同客戶需求,一般2-3周就可以提供極復雜表型成像系統(tǒng)的解決方案。目前WIWAM植物表型平臺分為WIWAM XY,WIWAM Line以及WIWAM Conveyor 3個系列。同時還可提供WIWAM Boxing柜式成像系統(tǒng),也提供野外表型成像系統(tǒng)設(shè)計方案。

WIWAM植物表型成像系統(tǒng)的優(yōu)勢

    所有表型平臺均為SMO工程部門自主設(shè)計、針對課題組的研究項目快速、準確提供技術(shù)方案,設(shè)備中諸多備件為自主生產(chǎn)和設(shè)計

    公司軟件設(shè)計團隊針對具體項目提供有針對性的WIWAM定制軟件

    SMO和VIB自主開發(fā)PAPPA數(shù)據(jù)管理、視覺成像和分析軟件,系統(tǒng)處理整個實驗設(shè)計的大數(shù)據(jù)

    PIPPA軟件可安裝在網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器上,網(wǎng)絡(luò)中每個計算機均可操作

    在PIPPA軟件內(nèi),可集合整合外來分析數(shù)據(jù)和文本

    易于獲取數(shù)據(jù)庫和原始圖像數(shù)據(jù)

    與客戶自有IT技術(shù)設(shè)施進行整合

    針隊客戶對表型設(shè)備運行環(huán)境了解欠缺的事實,提供表型設(shè)備生長室、室溫建設(shè)交鑰匙設(shè)計方案,實現(xiàn)環(huán)境參數(shù)。

    專門技術(shù)人員維護設(shè)備、定期指導維護硬件

    *代理密溝通服務(wù)、提供支持反饋

    自主電路設(shè)計、建筑內(nèi)電柜設(shè)計、機械電纜布線以及PLC管理所有室內(nèi)設(shè)計,將工業(yè)領(lǐng)域理念灌輸?shù)娇蒲兄?/span>

    采用開放式框架設(shè)計,整合世面上的所有種類成像模塊。

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