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Videometer植物/作物表型組學(xué)研究方法:成像品質(zhì)可視化分析

更新時(shí)間:2022-05-12 點(diǎn)擊量:1768

 

多光譜成像

多光譜成像與高光譜成像非常相似。用以獲得紫外(UV)和可見-紅外光譜測(cè)試樣本圖像中的所有像素。具體來(lái)說(shuō),多光譜成像系統(tǒng)通??梢蕴峁?到20個(gè)波段的圖像或圖像平面圖(如2個(gè)波段來(lái)自UV,3個(gè)波段來(lái)自VIS,5個(gè)波段來(lái)自IR)。這些波段之間沒有連續(xù)性。高光譜圖像是指每個(gè)像素形成一個(gè)幾乎連續(xù)的光譜。高光譜圖像的每個(gè)空間位置可能有數(shù)百個(gè)波段。如此龐大的數(shù)據(jù)量增加了成本計(jì)算工具的負(fù)擔(dān)和成本,不可能用于實(shí)時(shí)應(yīng)用。只有采用多光譜成像技術(shù)記錄一組小數(shù)據(jù)的信息的間隔光譜帶可以達(dá)到快速識(shí)別和檢測(cè)的目的。作為變革性成像系統(tǒng),多光譜成像系統(tǒng)可以基于濾波和色散裝置(如光學(xué)元件)來(lái)開發(fā)濾波器和可調(diào)諧濾波器,其特點(diǎn)是具有不同的間距和帶寬。例如一種多光譜成像系統(tǒng),由電荷耦合設(shè)備攝像機(jī)和少量特征帶干擾濾波器組成,可快速對(duì)色素成像。由于重量輕、硬件簡(jiǎn)單、采集速度快,多光譜成像具挑戰(zhàn)性的任務(wù)是選擇特征波長(zhǎng)來(lái)表示識(shí)別感興趣樣品的特征。多光譜成像的特點(diǎn)是利用不連續(xù)的多光譜圖像數(shù)據(jù),而不是冗余的高光譜圖像數(shù)據(jù)用于建模和評(píng)估食品質(zhì)量的圖像。收集到的多光譜帶存為若干個(gè)圖像,是3D(x,y,λ)光譜數(shù)據(jù)立方體。在立方體中,x和y代表兩個(gè)空間維度,λ表示光譜尺寸,其中VIS/IR光譜通??煞譃?個(gè)部分,即:可見光譜(380-780 nm)、近紅外光譜(780nm-2500nm),中紅外(MIR)光譜(2500-25000 nm),以及遠(yuǎn)紅外(FIR)光譜(25000-300000nm)。關(guān)于植物食品質(zhì)量和安全分析,多光譜分析成像系統(tǒng),設(shè)計(jì)用于獲取可見-近紅外區(qū)域(380至2500 nm)的光譜數(shù)據(jù)。收集的光譜可以提供樣品的復(fù)雜結(jié)構(gòu)特征與色素和諧波的強(qiáng)吸附有關(guān)(如一階諧波、二階諧波和三階諧波),或分子鍵(如C–H(脂肪族)的組合模式(變形和拉伸)C–O(羧基)、N–H(酰胺和胺)和O–H(羥基)官能團(tuán)).

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文獻(xiàn)報(bào)道的果實(shí)品質(zhì)可視化

多光譜成像系統(tǒng)是一種能夠同時(shí)獲取光譜特征和空間圖像信息的基本設(shè)備,是光電成像系統(tǒng)發(fā)展的和植物表型組學(xué)研究的重要方向。多光譜成像系統(tǒng)一般可提供具有3至20個(gè)非連續(xù)波段的圖像,并已在農(nóng)業(yè)和食品領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。從成像原理上講,多光譜成像技術(shù)就是把入射的全波段或?qū)挷ǘ蔚墓庑盘?hào)分成若干個(gè)窄波段的光束,然后把它們分別成像在相應(yīng)的探測(cè)器上,從而獲得不同光譜波段的圖像。

Videometer公司開發(fā)的多光譜植物表型成像系統(tǒng)VideometerLab通過(guò)測(cè)量植物在19種不同波長(zhǎng)的LED頻閃光下的成像來(lái)獲取有用的信息。這些圖像可以獨(dú)立分析使用,也可以疊加起來(lái)合成高分辨率的顏色圖像。Videometer備選模塊包括熒光成像模塊,能夠?qū)崿F(xiàn)葉綠素?zé)晒獬上瘢ㄈ~綠素a和葉綠素b)。

VideometerLab多光譜多光譜植物表型成像系統(tǒng)是一種新型的、功能強(qiáng)大且性價(jià)比高的植物表型成像測(cè)量系統(tǒng)?;A(chǔ)模塊包括可見光成像,UV紫外成像以及NIR成像??晒潭〝z像頭或移動(dòng)攝像頭。因拍照速度迅速,可實(shí)現(xiàn)較高通量成像。但需要手工較換樣品,可以測(cè)量較小的樣品。但分析軟件功能強(qiáng)大??蓪?duì)植物果實(shí)、種子、葉片、擬南芥等小植株、用多孔板培養(yǎng)的植物、多孔板里的葉圓片、種子、愈傷組織等,可以進(jìn)行高通量測(cè)量。該系統(tǒng)也可以對(duì)細(xì)菌、小型動(dòng)物、蟲卵等進(jìn)行高通量成像測(cè)量,進(jìn)行毒理學(xué)或其它研究。通過(guò)控制系統(tǒng)就可以進(jìn)行高分辨率多光譜成像。對(duì)于擬南芥等冠層平展的植物,可以進(jìn)行自動(dòng)的葉片計(jì)數(shù)等。

多光譜成像技術(shù)被認(rèn)為是高光譜成像技術(shù)的一次變革。它可用于無(wú)創(chuàng)快速評(píng)價(jià)果蔬品質(zhì)表型質(zhì)量。盡管已經(jīng)有幾種成像或基于傳感器的技術(shù)用于各種食品的質(zhì)量評(píng)估,但多光譜成像更具有應(yīng)用前景,多光譜傳感器廣泛應(yīng)用于在果蔬(如谷物、豆類、塊莖、水果和蔬菜)質(zhì)量評(píng)估中,常用建模方法和特征波長(zhǎng)選擇方法確定和可視化的果蔬的不同質(zhì)量參數(shù)(如物理化學(xué)和微生物方面)。根據(jù)文獻(xiàn)進(jìn)展,波長(zhǎng)選擇方法是連續(xù)投影算法(SPA)和回歸系數(shù)(RC)。多種化學(xué)計(jì)量學(xué)方法可用于果實(shí)品質(zhì)分析,用于分析果蔬食品的*模型是偏最小二乘回歸(PLSR)、最小二乘支持向量機(jī)(LS-SVM)、支持向量機(jī)(SVM)、偏最小二乘判別分析(PLSDA)和多元線性回歸(MLR)。

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不同植物性食品的品質(zhì)特性

Videometer果蔬品質(zhì)可視化

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榛子烤制程度

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榛子內(nèi)殼檢測(cè)

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多光譜成像檢測(cè)蘋果損傷

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蔓越莓硬度可視化-左邊2張圖為硬度高蔓越莓圖像

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榛子面積以面積排序

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菠蘿品質(zhì)評(píng)估

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番茄果實(shí)A中番茄紅素含量(A,mg/kg)和總酚含量(B,mg沒食子酸/100g)的可視化

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葉綠素a和葉綠素b含量可視化

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鐵觀音茶品質(zhì)可視化

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胡蘿卜切片水分含量可視化

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Single and Double Mutations in Tomato Ripening Transcription Factors Have Distinct Effects on Fruit Development and Quality Traits